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Reaction systems are an abstract model of interactions among biochemical reactions, developed around two opposite mechanisms: facilitation and inhibition. The evolution of a Reaction System is driven by the external objects which are sent into the system by the environment at each step. In this paper, we propose the Reaction Algebra, a calculus resembling reaction systems extended with a restriction operator. Restriction increases the expressiveness of the calculus by allowing the modeling of hidden entities, such as those contained in membranes. We define a compositional semantics and a behavioral equivalence for the Reaction Algebra, in order to enable the modular description of biological systems.
A Compositional Semantics of Reaction Systems with Restriction
Reaction systems are an abstract model of interactions among biochemical reactions, developed around two opposite mechanisms: facilitation and inhibition. The evolution of a Reaction System is driven by the external objects which are sent into the system by the environment at each step. In this paper, we propose the Reaction Algebra, a calculus resembling reaction systems extended with a restriction operator. Restriction increases the expressiveness of the calculus by allowing the modeling of hidden entities, such as those contained in membranes. We define a compositional semantics and a behavioral equivalence for the Reaction Algebra, in order to enable the modular description of biological systems.
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Utilizza questo identificativo per citare o creare un link a questo documento: http://hdl.handle.net/11383/1891720
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2021-2023 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
